Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC4Q8WW27 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms