Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MCPH1-203ENST00000519480 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ROPN1-201ENST00000184183 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 STPG1-203ENST00000374409 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SPDYE9P-202ENST00000571071 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SPDYE11-203ENST00000573748 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SPDYE10P-201ENST00000576332 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SVIPQ8NHG7 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AL606534.6-201ENST00000611420 1838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 FAM239C-201ENST00000381105 2118 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ACSL1-204ENST00000504342 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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