Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP43Q8NFH3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms