Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms