Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD53Q8N9V6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms