Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPAP2Q8IXW5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms