Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms