Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRCQ7RTU9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRCQ7RTU9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms