Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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