Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED27Q6P2C8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms