Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RWDD4Q6NW29 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms