Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms