Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms