Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms