Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARHGAP29Q52LW3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms