Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PKDCCQ504Y2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms