Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LETM2Q2VYF4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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