Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ISXQ2M1V0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms