Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms