Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF239Q16600 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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