Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK4Q16099 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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