Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSME4Q14997 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME4Q14997 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms