Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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