Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ATRQ13535 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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