Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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SKP2Q13309 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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SKP2Q13309 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SKP2Q13309 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP2Q13309 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SKP2Q13309 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP2Q13309 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP2Q13309 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP2Q13309 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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SKP2Q13309 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP2Q13309 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SKP2Q13309 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SKP2Q13309 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SKP2Q13309 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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