Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NME3Q13232 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NME3Q13232 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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