Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MKRN3Q13064 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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MKRN3Q13064 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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MKRN3Q13064 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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MKRN3Q13064 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MKRN3Q13064 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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