Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSTF3Q12996 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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