Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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