Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWF1Q12792 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWF1Q12792 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms