Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC15Q0P6D6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms