Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SRSF4Q08170 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms