Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOS1Q07889 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOS1Q07889 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms