Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms