Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP1Q00587 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms