Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms