Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMF1P82094 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms