Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPAP53621 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPAP53621 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPAP53621 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms