Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IDH3AP50213 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IDH3AP50213 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms