Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP4P49662 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP4P49662 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms