Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms