Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMPOP42166 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMPOP42166 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMPOP42166 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMPOP42166 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMPOP42166 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMPOP42166 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms