Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBP2P32456 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBP2P32456 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms