Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA6P31267 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA6P31267 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms