Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRB3P28472 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms