Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms