Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRAP18433 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRAP18433 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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