Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms