Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA1P14867 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA1P14867 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA1P14867 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA1P14867 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA1P14867 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms