Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOP08100 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOP08100 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOP08100 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms